《行水金鉴》全书约120万字，所收资料上起《禹贡》，下至康熙末年（1721），包括黄河、长江、淮河、运河和永定河等水系的源流、变迁和施工经过等，按河流分类，按朝代年份编排。编辑这样的资料书，在当时是创举，其体例多为后世所沿用。后人又编有雍正初到嘉庆的资料《续行水金鉴》（清黎世序等人纂修）和民国时期的《再续行水金鉴》（武同举等人编辑）等。